Mladé, bujně rostoucí sazenice jsou náchylné k napadení pidikřísky, zejména pidikřískem zemákovým (Empoasca pteridis) a pidikřískem zeleným (Empoasca flavescens). Okraje posátých listů žloutnou a hnědnou, čepele se deformují, případně dochází k potlačením růstu listů a terminálu. Přítomnost pidikřísků někdy prozradí bílé svlečky na rubu listů. V případě nutnosti lze od začátku do poloviny června provést ošetření insekticidy, pokud dochází k náhlým náletům z vojtěšky či jiných porostů, je možné ošetření opakovat.
V posledních letech se na muchovníku vyskytovala síťnatka Corythucha cydoniae. Následkem sání se na líci listů objevují nejprve bělavé tečkovité skvrnky, později listy žloutnou a hnědnou, silně posáté výhony mohou zasychat. Larvy i dospělci (cca 3 mm) charakteristickými síťovitými křídly sají na rubové straně listů a znečisťují ji hnědočernými výkaly. V případě potřeby je možné od poloviny května do poloviny července aplikovat insekticidy.