Pokud byla studna odborně vyčištěna (stříkání stěn vodou s dezinfekcí po předepsanou dobu, atd.) a stále jsou ve vodě přítomny bakterie, je pravděpodobně již znečištěna voda (pramen), který přitéká do vaší studny. Pokud by se jednalo o průsak kolem zhlaví (pokud tam nemáte vyloženě díry), docházelo by k šíření bakterií v delším časovém horizontu.
Jak už zde někdo psal, je vhodné si vyhledat směr, odkud váš pramen přitéká a které možné zdroje znečištění na něm leží. Kromě již zmiňované děravé žumpy (používané) je nejčastějším zdrojem znečištění jiná, zanedbaná studna.