Samozřejmě stromy v zahradě se mají vykopávat a ne kácet, už proto, že na jejich místo obvykle vysadíme jiné a pro ně je třeba kopat jámu. Vykopávat strom je snazší než vykopávat pařez, neboť kmenem se dá páčit. Někdy to ale jinak než pilou nejde, např těsně u cesty nebo v plotě.
I po vykopání kořenů může dojít k podrůstání, protože všechny drobné kořeny neodstraníme. Takové výmladky ale jdou dobře vyrýt, zatímco ty, co vyrůstají z pařezu a silných kořenů, kde mají navíc zásobárnu živin, vyrýt nelze, ty jsou mnohem úpornější.
