V podstatě uvažujete správně. Už při současném řezu uvažovat o tom příštím. Napadené větvičky se nemusí vždy odstraňovat celé, stačí ta část, která je napadena nejvíce.
Silnější větve je nejlépe odstranit či sesadit na nížší rozvětvení v létě, hned po sklizni. Pro tyto účely je dobré v současné době si označit místa budoucího řezu za vegetace, protože teď se to nejsnáze určuje.
Já si na to místo vždy uvážu kousek bílého provázku, lze to třeba i latexem používaným k zatírání řezných ran.

Foto pořízené za vegetace by, samozřejmě, pomohlo více k určení příčin nemoci.
Jako prevence proti napadení (jakoukoliv houbou) je včasné a důsledné uklízení opadaných listů pryč ze zahrady už v průběhu vegetace.
Omezit napadení houbou Stigmina lze, podobně jako u kadeřavosti, postřikem peckovin na podzim pri opadu listů a v průběhu zimy, kdykoliv při teplotě alespoň 7°C a na začátku rašení měďnatým fungicidem, nejlépe v hydroxidové formě.

Během vegetace by na houbu Stigminu účinkovaly postřiky např. Horizonem, Delanem či Syllitem, ale toto se běžně nedělá.